1945年，程慈航作为一名游学归来的刑侦专家，刚刚在码头遇到了一场险情。一只铁箱成为了多方势力争夺的焦点，里面存放着日军细菌武器的绝密档案。铁箱被警察厅厅长莫采石存放在档案馆的密室里，然而在一夜之间却神秘失窃，案情从此变得扑朔迷离不可捉摸。
　　程慈航意识到此案件的重要性，因为它牵扯到日军的秘密细菌武器。他决定向长期以来的“叔叔”莫采石请战，希望能够揭开这一谜团。总署刑侦警察局局长霍然随即特聘程慈航为布衣侦探，授权他调查此案。程慈航上任后，迅速发现了一些蛛丝马迹，并逐步接近真相。然而，他却屡遭阻挠，每当他接近关键线索时，总有人先他一步将相关人员杀害，使得案件的幕后黑手更加神秘。程慈航将如何解开这个扑朔迷离的案件，找到失踪的档案，以及揭示幕后黑手的真正身份，这一切都将在剧中逐步揭晓。

　　根据江苏省文联主席章剑华的长篇纪实文学《故宫三部曲》改编，讲述了一个关于爱和承载的故事，再现了九一八事变之后，华北岌岌可危，马衡、易培基等故宫知识分子，抱着“文化之根在，中国不会亡”的信念，将故宫文物迁出北平的那段文化抗战悲壮史。

　　父亲车祸去世后，南江河边的“福康里”蜗居着母亲和她的五个女儿：红梅、红兰、红竹、红菊和五妹。母亲特别疼爱五妹，计划和她一起住在老屋，期望在将来由五妹照顾她养老送终。这种安排引起了四个姐姐的不满，因为这样一来，她们将无法与母亲共度晚年。
　　这一家庭内的紧张关系体现在姐妹之间，而家中的房子成为她们心中的一个难以解开的结。尽管姐妹们本应是亲密无间的家人，但母亲的特殊偏爱导致了妹妹之间的矛盾。五妹与邻居家的李军是青梅竹马，两人关系深厚。然而，红菊却夺走了五妹心上的人，加剧了家庭内的复杂局面。随着大姐红梅从贵州插队归来，她带回了一个女婴，这是她与一个叫林江的知青生所生的。

　　郝冬（黄轩 饰）在收听午夜电台节目时，谈到了自己失眠的痛苦经历。郝冬的女友——电台DJ依凡（薛凯琪 饰）开始对他进行心理辅导。而郝冬却对她讲述了自己的梦魇：一个白衣飘飘的长发女子（周楚楚 饰）从高楼坠落，这令他难以安眠。而更令人恐惧的是，他那些关于九里村的童年记忆，虽然支离破碎，却令人不寒而栗。当时，建国初期，一对夫妇来到了九里村，支援村里农业生产建设，丈夫叫建国，是杂交水稻专家，他的妻子名叫骆晓月。来到村子没多久，建国因下河触电身亡，而晓月则被村长的智障弟弟骚扰。后来，晓月竟然在夜间被人用柴刀杀死。警察调查中，发现智障弟弟为最大嫌疑人，但是由于其为精神病，故未受惩罚。20年过去了，郝冬再度回到九里村，住在舅舅家中，又遭遇了一连串令人毛骨悚然的诡异景象。当他在一步步揭开真相的时候，同时也陷入了对于凶手杀人的回忆中，陈年往事如疮疤被揭开，真相令人瞠目结舌……

　　在一个阳光灿烂的寻常日子，临街某栋大楼一件空旷的房间里，一个面目清俊的男子正不动声色地通过高倍望远镜观察着繁华大街上往来的人流。片刻之后，在男子的指示下，隐藏在人群里的两位侦察人员不露痕迹地控制了他们早已盯上的目标1，然而，正在此时意外发生了————一辆疯狂的摩托车突然不顾一切地朝目标冲去，企图杀人灭口，执行任务的侦察员刘海山立刻转身把目标1推向安全地带，自己没躲过杀手的袭击，而杀手在即将被与刘海山一起执行任务的侦察人员李石捕获之时服毒自尽……

郝冬（黄轩 饰）在收听午夜电台节目时，谈到了自己失眠的痛苦经历。郝冬的女友——电台DJ依凡（薛凯琪 饰）开始对他进行心理辅导。而郝冬却对她讲述了自己的梦魇：一个白衣飘飘的长发女子（周楚楚 饰）从高楼坠落，这令他难以安眠。而更令人恐惧的是，他那些关于九里村的童年记忆，虽然支离破碎，却令人不寒而栗。当时，建国初期，一对夫妇来到了九里村，支援村里农业生产建设，丈夫叫建国，是杂交水稻专家，他的妻子名叫骆晓月。来到村子没多久，建国因下河触电身亡，而晓月则被村长的智障弟弟骚扰。后来，晓月竟然在夜间被人用柴刀杀死。警察调查中，发现智障弟弟为最大嫌疑人，但是由于其为精神病，故未受惩罚。20年过去了，郝冬再度回到九里村，住在舅舅家中，又遭遇了一连串令人毛骨悚然的诡异景象。当他在一步步揭开真相的时候，同时也陷入了对于凶手杀人的回忆中，陈年往事如疮疤被揭开，真相令人瞠目结舌……

　　故事发生在抗日战争末期的上海。51号兵站是我新四军物资转运站，由于出现叛徒，兵站无法运转，党派梁宏（杜淳 饰）以青帮“小老大”身份前往上海重建兵站以尽快恢复运转。梁宏家世显赫，他的突然回家引起特务马浮根（姚安濂 饰）等人怀疑，为了敲山震虎，他通过淞原（寇振海 饰）教授和日本宪兵队长田中（张秋歌 饰）搭上关系。得知敌人手中有一批盘尼西林药品，而这批药的主人是军统特务徐曼丽（桑叶红 饰），梁宏与同志们制定好了抢药计划，很快打开了吴淞口通往苏中根据地的运输通道。梁宏还利用敌人内部矛盾，成功干掉了叛徒程路，并化装成日本人抢走一批我兵工厂急需的无缝钢管，这引起了敌人的警觉......