Mark哥（周润发 饰）和志民（梁家辉 饰）是堂兄弟，两人是越南华侨，现正在香港发展。岂料越战打响，两人都十分担心仍然居住在越南西贡的志民的父亲松叔的安危，为了凑足钱将志民父亲接到香港，两人决定帮当地黑帮走私军火到越南。岂料他们在越南遭到了丧邦的伏击，关键时刻幸亏香港黑帮老大的女友英杰（梅艳芳 饰）及时相救，两人才幸免于难。逃过一劫的三人在西贡渡过了一段快乐时光后，英杰辞别了两人。随后Mark哥和志民将松叔顺利接回了香港。回港后，两人过着安稳平静的生活，只是一直都没有打听到恩人英杰的消息。突然有一天，英杰出现了，重逢令三人都十分开心。只是，一场祸事也在悄悄逼近……

　　著名影星詹二帮（梁家辉饰）常常出演一些英雄类人物的角色，但现实生活中却胆小如鼠，使深爱的妻子曼琼（余安安饰）离开了他，自此他便跟两个女儿忌廉（钟欣桐饰）与脆皮一起生活了。
　　铁男（陈小春饰）与Janet（田朴珺饰）均是国际刑警，得知恐怖分子龙一（徐锦江饰）将到香港去取另外的生化武器，在香港与恐怖分子交手的过程中，误入了二帮的家里，铁男被注射了智力退化的病毒，智商只有4岁儿童的程度。曼琼从好莱坞回来打算跟二帮商议合作的事情，却遭到恐怖分子的闯入，他们得知丢失的病毒就在二帮家中。
　　在与恐怖分子斗争的过程中，二帮为了女儿为了前妻，显现出以往少有的勇敢才智，顺利抓拿犯罪分子以为，还赢回了家庭团员。

　　著名作家、冒险家卫斯理（许冠杰 饰）在埃及游历时，受到了大富翁霍普的请托，后者请卫斯理寻找他的师兄高大威（泰迪罗宾 饰）。卫斯理在收到高大威主动寄来的信件后，赶赴尼泊尔与其汇合。高大威其时正为青帮龙头白奇伟（狄龙 饰）寻找传说中的喜马拉雅龙珠，眼看成功在即却身陷“邪教”的追杀中，卫斯理帮助高大威潜入宗教内部夺得龙珠，在撤出时飞机失事高大威不知所踪，逃跑失败的卫斯理被带到只有五岁的小佛爷面前，卫斯理受小佛爷感化，承诺追回龙珠，以延续此一教派。
　　返回香港的卫斯理再遇霍普助手，并拒绝向对方交出龙珠，第一时间赶到白公馆，白奇伟之妹白素（王祖贤 饰）是卫斯理的书迷，在白素帮助下，卫斯理取得龙珠，但是一场三方围绕龙珠的争夺战才刚刚开始……

　　探员大细与外籍女神探欲破一诱骗少女往外埠卖淫集团，却被油脂青年生事而破坏行动，无功而回。飞车权以婴孩作掩饰而偷运枪械，却于大车上被探员散仔男无意揭破。权见事败，跳车而逃。负密令返港之杀手荷兰飞及荷兰牛得悉权难完成使命，杀之灭口。二人欲械劫投注站却被大细与散仔男知悉而包围……

　　袁世凯（何家驹 饰）为登基称帝笃信邪教，教主赠送玉扳指佑其成功，岂料袁世凯将扳指送给四王爷之三公主沈玉（李嘉欣 饰），并计划立她为皇后。教主令袁世凯收回扳指，与此同时，潜伏袁世凯身边的孙文革命军干部杨君（刘德华 饰）掳走沈玉以阻止袁登基。李督军（刘家辉 饰）自此奉袁世凯之名沿途追索杨、沈二人，杨君在路经过宝芝林时邂逅黄麒英（郑少秋 饰），遂将护送沈玉之重任托付于黄麒英和痴迷醉拳的黄飞鸿（季天笙 饰）父子二人。飞鸿护送沈玉的路上遭密探（任达华 饰）截杀，致使代步汽车撞入仁伯（刘家良 饰）的酒庄，醉拳高手仁伯帮二人解围，但又留下他们做工来弥补酒庄损失，由此卷入玉扳指争端战，李督军不久率军赶到，各路高手掀起连番激战……

　　15年前，阿龙（李璨琛饰）父因母亲珊姐（吕珊饰）烂赌向大耳窿借还债，导致意外车祸死亡，因此阿龙及妹妹雯雯（吴俐璇饰）非常痛恨母亲，但阿龙为雯雯之生计及保护家人，投靠天神（林雪饰）阿窿集团，开始他的阿窿生涯。
　　阿龙鼓励雯雯考警察部队，但因阿龙的职业背景，令雯雯承受压力，导致兄妹俩感情破裂，最后雯雯更离开警察学院。
　　一天，一个自称是专门铲除大耳窿集团的特别行动组找上阿龙，要他以卧底身份收集天神犯罪证据，以消灭放高利贷活动。正当阿龙努力搜寻天神罪证时，妹雯也加入天神的集团，还为了争上位靠拢处处与他为难的黑狗（张兆辉）身边。
　　黑狗是天神的养子，一直深受天神重视，然而自从阿龙的加入，令他有感地位不保，一直视阿龙为敌，他与天神都不知道雯就是龙的妹妹，还爱上雯。而黑狗身边已有一个欣（温碧霞饰），后者的父亲原是欠债者，欣为了救父及顾母，只好接近黑狗，但是雯的出现，也令欣感到自己地位受威胁。
　　欣觉得雯的出现绝不是偶然，因此怀疑对方的真正身份，她劝黑狗别太信任对方，但黑狗不信，为了找出证据，黑狗设了个陷阱试探雯，没想到雯真的中计，在千钧一发时刻，知道妹身处险境的龙却出现……

　　警察张大海（连凯 饰）开车押送犯人司徒奇（林家栋 饰）回警署，却在半路上遭遇了意外误打误撞之中闯入了寨城。寨城中聚集着来自各地的不法之徒，他们在此安营扎寨，经营和维持着属于自己的法律，是一个典型的“三不管”地带。寨城的头目乌鸦扣押了张大海和司徒奇两人，扬言要杀掉身为警察的那一个。
　　此时，妓院老鸨阿玲（田蕊妮 饰）站了出来，诬陷司徒奇为警察，使得张大海获得了自由。原来，司徒奇和张大海是曾经的恋人，两人还有一个女儿阿恩，可是后来司徒奇抛弃了母女两不知所踪。阿玲希望司徒奇能够帮助她们离开寨城，保护阿恩不受乌鸦的侵害。

　　龙蛇混杂的监狱世界，一直由江湖巨头滚筒（谭耀文饰）和被判终身监禁的刀疤（张建声饰）两大势力平分天下，却因为冤狱新囚麦建天（栢天男饰）的出现，改变了风平浪静的监狱生活。 建天先被刀疤连番威迫放弃上诉，后被揭发与滚筒有着深仇大恨而惨被欺凌，建天为求保命只好接受同仓狱友浩正（张继聪饰）的建议，合谋策划了精密的越狱计划。 为了避开邓狱长（黄德斌饰）的严密监管，浩正设局游说滚筒协助，同时却被刀疤识破而被迫接受加盟。就此，狱中四人只好放下成见共同联手，上演一场惊心动魄的逃狱行动！

　　香港特警队督察蓝朗（方中信饰）在侦察一宗重大罪案期间，冒死前去营救被黑社会绑架的女友（蒙嘉慧饰），却反遭陷害，被迫停职退出警界。朗只好在海边开设小餐厅，希望过平静的生活。可是黑社会势力并没有放过他。十年後，从澳洲回港的年轻人阿孝（陈宇琛饰）来到海鲜酒家工作，其父当年被蓝朗误杀，而阿孝正要来查明真凶。

　　一代宗师李振强（李小龙 饰）和武林高手秦谷（黄正利 饰）是生死之交，秦谷的莫名死亡让李振强决心找到背后的真凶。哪知道在这过程中，李振强不幸遇害，只留下了一个和死亡塔有关的秘密，没有人能够解开。
　　振国（金泰中 饰）是李振强的弟弟，得知哥哥的死讯，闭关修炼多年的振国决定下山，为兄寻仇。追随着李振强留下的线索，振国来到了神秘的山庄之中，经历了诸多生死攸关的险情，并最终打开了秘密通道，来到了潜藏在山庄之下的宫殿之中。在这里，等待着他的竟然是正是秦谷，振强和振国都落入了他一手策划的阴谋漩涡之中。秦谷想要将振国杀死毁尸灭迹，遭到了后者的奋起反击。

　　承接《潜行狙击》电视剧结局，梁笑棠Laughing（谢天华饰）谋杀苏星柏（黄宗泽饰）罪名成立，判处无期徒刑；梁笑棠在狱中结识大学教授霍天任（吴镇宇饰），教授外表斯文，与世无争，但却能以心理陷阱收服穷凶极恶的 “巨川”（林雪饰）。其实教授是高智商的犯罪心理学家，擅用冷读法，可以洞悉对方心理活动和秘密，于无声中掌控他人。
　　神秘女子（文咏珊饰）到狱中探望梁笑棠，其隶属比警队更高层次的保安局，原来，梁笑棠入狱是再次担当卧底角色。当日，杀苏星柏是另有其人，保安局副局长（麦长青饰）怀疑整件事跟潜藏警队中的黑警团伙有关，所以借势令梁笑棠入狱展开调查。
　　梁笑棠亦步亦趋主动接触狱中目标人物前毒品调查科警长“大切”（杜汶泽饰）在将要取得进展时，发现教授亦同时以心理治疗法，令“大切”多次精神错乱，直至向“大切”发出了死亡暗示。
　　一场敌友难分、正义与邪恶的生死对决在实力极不均衡的态势下火爆展开了。

　　连串黑帮老大遭绑架、勒索以及撕票，警方对此案调查毫无头绪。警队B组队长张博文（任达华 饰）曾为警队立下汗马功勋，但从其妻子遭黑帮报复被杀后，加上A组队长的排挤，他开始消极处世。警方接到报案，又一黑帮头目遭绑架，新任总警司古国强（陈法拉 饰）召集两组人马对此案展开全面侦察。由于A组队长轻敌，加之犯罪分子做案手法高明，配合严密，在一次行动中警方遭受重创。此时，在古警司的请求下，张博文带领手下仅有的两名探员开始暗中调查此案。经过慎密调查之后，张博文把犯罪分子的头目目标锁定为曾为警方督察的何湛森（苗侨伟 饰），他的手下包括多名原飞虎队成员，而何湛森绑架黑帮老大的真实目的是为其被黑帮报复杀害的弟弟的报仇……

　　《极斗4之暴杀令》故事讲述香港的家庭暴力和女性被侵犯事件，各人对事发的反应，当中有人选择以暴易暴，替天行道，其实为社会和法律不容，因为香港无蝙蝠侠，不可以执行私刑，其实电影带出社会问题令人反思。
　　《极斗3之雅博渡口》是「与神格斗」后，这次《极斗4之暴杀令》是「与仇恨格斗」，电影主题与性侵犯有关，并表明调子相当灰暗。“极斗4之暴杀令”有点像80年代经典电影【山狗】，山姆哥借电影致敬。

　　青年金水（威龙 饰）通过非法途径偷渡到法国，目的是为了将他的母亲和妹妹从国内接出来。为了实现这个目标，他冒险贩卖假护照，结果成为警方通缉的对象，不得不逃离法国。他前往加拿大投奔好友快锦（任达华 饰），一个虽然不拘小节但心地善良的青年。
　　快锦决定帮助金水渡过困境，毅然接纳了他。然而，快锦因赌博欠下高利贷，被黑帮追杀，这时身手高强的金水也同样帮助快锦解决了麻烦。两个兄弟共同面对了一个又一个的困难，但金水却与快锦心爱的女人佐藤（柏原芳惠 饰）产生了情感。面对爱情和友情的冲突，金水面临着艰难的选择。

　　货车司机马汉强（成龙）赴美向移居美国的骠叔祝贺新婚之喜，知晓其打算婚后与黑人妻子过安静的晚年生活，经营多年的超级市场也已卖给了年轻寡妇Elaine（梅艳芳）经营。由于一见面就对Elaine有好感，马汉强主动协助Elaine打点起业务来。
　　不久，以Johnny为首的一帮朋克党开始恶意捣乱破坏超市，面对他们，马汉强面无惧色勇敢地用起了自己的拳头，同时不忘晓他们以人生大义，然而这波未平那波又起，马汉强又被卷入了钻石赃物被盗的漩涡，受到了黑手党的追杀。

　　亚洲电脑业巨头周氏兄弟发现其公司内部的电脑系统于一夜之间感染病毒全部瘫痪，四处求救之时，一个自称“天使”的神秘高手出手相助，麻烦成功解除，令周氏兄弟十分钦佩。出于好奇，他们提出与“天使”见面道谢，不想应约而至的“天使”是一对拥有天使面容的姊妹花——陈爱琳（舒淇）和陈爱群（赵薇），而之前的电脑中毒事件，也是由这对姊妹花一手策划：她们是想借此突破周氏公司森严的保安系统，实施更大的阴谋。
　　女警江日红（莫文蔚）闻得风声，在爱琳和爱群实施阴谋时展开调查，不想仍让她们得手。随后，在周氏兄弟的策划下，爱琳死于乱枪之下，可是现场留下的指纹却是江日红的。无奈之下，江日红与爱群联起手来，两人逐渐由敌手变作朋友。

　　《监狱风云》的续作，资深囚犯阿正（周润发 饰）因为与前任科长（张耀扬 饰）的过节而延长刑期，服刑期间母亲病逝，儿子良仔被送到孤儿院甚至对父亲产生怨恨。阿正一心想申请外出看望儿子却遭到狱警头子“鬼见愁”（徐锦江 饰）的诸多刁难。“鬼见愁”因收买狱中大陆帮首领大圈龙（陈松勇 饰）不果 ，把其视为眼中钉，并且从中唆使挑拨使得大陆帮与阿正之间产生隔阂。一次陷害使得大圈龙不得不出逃，被误会陷害大圈龙的阿正也被迫逃走，逃跑途中两人相遇并产生了一段“难兄难弟”般的友情。最后阿正被再次抓回狱中，在暴乱中阿正终于得到机会和”鬼见愁“短兵相接。

　　洛培（狄龙 饰）刚刚出狱，他决定改过自新。然而，当他前往银行提款时，却被劫匪吴诚才（吴耀汉 饰）挟持为人质。不幸的是，警方梁沙展错误地认为这次劫案是洛和吴合谋的。在劫案中，洛培受了伤，吴诚才带他回家治疗。在这个过程中，洛培了解到吴诚才劫银行是为了筹集治疗患病女儿的费用。由于对吴诚才的遭遇产生同理心，洛培决定协助吴父女逃离香港。
　　为了购买假护照，洛培惹恼了匪首大哥成（林聪 饰）。为了保护吴父女，洛培安排他们先躲在他女友家中，然后安排他们上船逃离。当他们发现吴诚才的女儿小梅奇迹般地康复时，众人正为此感到高兴时，大哥成等人却追踪到了他们，意图加害他们。

　　历经艰辛刚摆脱非洲土人的追杀，飞鹰Jackie（成龙）就接到伯爵的急电，要其迅速赶到西班牙。二战末期，知道自己来日不多的德国纳粹把在欧洲抢掠所得的数万吨黄金隐藏在了非洲撒哈拉大沙漠一个秘密基地，伯爵急电Jackie，正是要其配合冷艳的考古专家Ada（郑裕玲）再赴非洲寻找这批黄金，途中，藏金副官的外孙女Elsa加入寻宝队伍。
　　费尽艰辛终抵大沙漠后，Jackie一行人于一次意外无意发现了藏金基地，而就在他们欣喜若狂之际，一个神秘大汉突然出现，一场生死博斗遂即展开。

　　日本珠宝商人山本（岳华 饰）在东京举行珠宝展览会期间遭到雌雄大盗中川和西协美智子的血腥洗劫，警官藤冈弘的助手在枪战中身亡。在此之后中川和西协赶赴香港，准备采购军火支持日本赤军的运动。
　　得知消息的藤冈亦尾随来港，香港警方派出阿丽（杨丽菁 饰）接机，同期山本也抵达香港。藤冈埋怨香港警方办事不力，在酒吧中偶遇西协，引发枪战，造成数人死亡。被港警扣留准备遣返日本的藤冈设法逃出，追至山本住处，雌雄大盗尾随前来。双方发生新一轮的火拼……