毕仁陪阿柯往小梅沙旅游，享受阳光海滩。阿柯无意中拾获镶有钻石的太阳眼镜，就此招惹邪灵缠身。毕仁马上把太阳眼镜丢弃，与阿柯回港。回港后，阿柯发现眼镜仍在旅行袋，以为毕仁大意没有丢掉，两口子为此吵架。阿柯入睡后，戴上眼镜、穿上泳衣在大厅游泳，醒来时告诉龙娣在梦中目睹少女在沙滩被杀。阿柯把眼镜带回海中，不幸遇溺，迷糊间看到凶案过程。

　　维拉德（克利斯丁·格拉夫 Crispin Glover 饰）是一个性格十分内向腼腆的青年。在公司里，他的反应迟钝和笨手笨脚惹出了许多的麻烦，致使他遭到老板和同事们的无情嘲笑排挤，终日生活在压抑和委屈之中。维拉德唯一的两个朋友是本和苏格拉底，它们是两只拥有着高超智商的老鼠。
　　不幸的是，维拉德的同事在偶然之中发现了苏格拉底的存在，苏格拉底被当成普通的老鼠被踩死了。这巨大的悲剧给维拉德和本带来了毁灭性的打击，一人一鼠在绝望之中决定联手向人类复仇，他们率领着终日生活在阴影里的鼠族大军，拉开了一场充满了惨叫和鲜血的，跨越了人类和鼠类两个种族之间的荣誉之战。

　　平安时代，百鬼夜行，封鬼仪式正在右大臣藤原安麻吕府邸进行。安麻吕之女日美子（深田恭子 饰）戎装登场，一箭命中靶心，引来全场惊叹。这位被喻为“连鬼都不敢接近”的公主，却令源博雅（伊藤英明 饰）暗自倾心。天现异象，京都骚动，魍魉横行。平安京已有四人遇害，民间出现驱鬼术士幻角（中井贵一 饰），日美子亦在异象后开始梦游。博雅为此替右大臣来请安倍晴明（野村万斋 饰）商谈。与此同时，宫廷供奉的出云三神器之一草薙剑也出现了异动。晴明受天皇所托，与博雅开始调查种种异况背后出云与大和的隐秘渊源。
　　博雅和夜弹琵琶的神秘少年须佐（市原隼人 饰）相识为乐友，须佐负伤被日美子所救，三人在右大臣府邸相逢。同一时刻，右大臣主动找到晴明，坦白了十八年前天现异象时，大和攻打出云的事实……
　　本片为电影《阴阳师》续作。

　　江力申（唐文龙 饰）天生阴阳眼，跟随江湖大佬志雄工作，心地善良，乐于助人。一次，他意外遇到游魂钟太寻替身，不忍见其陷入不归之境，于是将盈莹救了回来。然而，这个善举却破坏了阴阳定律，激怒了本应安息的恶魂钟太。为了让爱子忠仔能够早日转世投胎，钟太开始苦缠不休地找寻力申，甚至将忠仔附在他身上，使他陷入生死危机。
　　江力申的好友毕基找来毕仁替他驱鬼，但毕仁的能力有限，未能解决问题，反而惹怒了钟太，使情况雪上加霜。毕基只好请来龙娣解决这个麻烦。在龙娣的调查下，才发现力申的善意导致了灾祸的连连发生，盈莹家中也遭受了不幸。原来，钟太因怀孕时溺水而亡，爱子忠仔至今未能转世投胎，而寻替身的行动多次被力申破坏，导致钟太怨念重重。龙娣作为谈判专家，成功劝说钟太接受事实，找来五轮法王查问忠仔未能投胎的原因，以期解决这场纠纷。