1997年2月から1998年1月までテレビ放送された、リメイクヴァージョン。『美少女戦士セーラームーン セーラースターズ』の後継番組として製作さた。
　　本作におけるハニーはアンドロイドでは無く空中元素固定装置によって生み出された人造生命であり、最終回では青児との間に生まれた娘が登場している。また、ライバルとしてもう一人のハニー『ミスティーハニー』が登場している。
　　この作品では永井豪は「原著作」である。その上で、実質の原作者・飯坂友佳子が少女漫画に翻案した形で企画当初より参加・コミカライズした。
　　番組終盤にハニーをサポートする女性科学者役として初代ハニー役・増山江威子がゲスト出演している。
　　第1作と比べかなり少女アニメらしい作品になった。これは枠として『セーラームーン』の視聴者層にそのまま見続けてもらうために制作されたためである。『キューティーハニー』の原作や第1作のようなギャグ・お色気要素が少ない。あわせてオリジナルシリーズにはなかった恋愛、近親憎悪、三角関係、結婚、出産などの女性視聴者を意識した要素が加えられた。
　　バンダイのアンケートによると、1997年の「好きなキャラクター」で3歳～5歳女児と6歳～8歳女児の2部門で本作が1位を獲得している。
　　10月以降は土曜18:30から（ただし関西地区は放送時間繰上げ）に変更になったが、およそ一年で終了、次番組『アニメ週刊DX!みいファぷー』に交代した。
　　朝日放送では放送時間移動を機に提供表示がブルーバックに変更されるとともに、提供クレジット時のBGMも廃止された。

　　千年前，灵兽蜃与玄水祭司萤情同姐弟，然而蜃顽劣之极，误入魔道，以至生灵涂炭。萤为救天下苍生与汐族协力将蜃魔哄骗封印。封印之时，萤一念之仁，为蜃魔留下一线生机。此后，萤牺牲自己以赎罪，汐族众人也被困于凝固的时间之中。千年后，蜃魔复苏之日渐近，当年的萤转世为玄水祭司瞳溟。蜃魔沉睡千年，只为报复萤的背叛，他附身在了瞳溟深爱的妹妹瞳洸身上，借瞳洸之手毁灭了瞳溟所守护的一切，爱的守护和恨的利刃将会牵扯出怎样的恩怨情仇……

公元2019年（正化31年），为了取缔扰乱公共秩序和风俗，侵犯人权的行为，而制定的“媒体良化法”已经经历了30年的考验，媒体良化委员会与“图书队”之间的战争席卷了整个日本。                                                                      　　渴望成为防卫员的图书队员笠原郁，没有向双亲吐露自己的心声，每天勤奋地进行着军事训练。郁在高中时，曾经差一点被一名媒体良化队员抢去书本，好在一位图书队员将其解救。为了成为正义的伙伴，郁把那位连脸都没有记住的图书队员当作是王子，并决定自己也要加入图书队，担负起守护书的责任。                                                                      　　不久，有着卓越运动能力和满腔热情的郁，被派遣到 “图书馆・特种部队”里……

　　影片架构在一个充满阴影和灰暗色彩的超现实主义世界中，剧情的主角是两个没有提及名字的少年（根津甚八 配音）与少女（兵藤真子 配音）。少女随身带着一颗神秘的蛋，她花许多的时间在某个歌德式的死城里搜集各式瓶子与手工艺品。身上背着一把十字型武器的少年在某天也随着一种神秘的机械来到这个城镇。同时，巨大腔棘鱼的身影在城镇上方出现，城市里的人也成群的活过来开始用长枪猎捕这些鱼群。在少女如巨穴般的瓶子中，就像个庇护所一般，里面收藏着蒐藏品。少年等少女入睡后将那颗神秘的蛋打破。少女表现得很生气并紧跟着已经离开的少年。最后少女沉入了溪谷中死去，她口中吐出来的气泡最后都化作了一颗颗的蛋。
　　本片由日本导演押井守以及知名插画家天野喜孝合作，德间书店于1985年发行，并于2007年以DVD形式再版。影片旁白由野田圭一担任。