坐落在这个世界的某个角落的超大型综合动物园「加帕里公园」，依靠着那里的神秘物质「砂之星」的力量，动物一个个都变成了人类的模样。变身成为「兽娘」，来访的人们把她们称为「朋友（friends）」。在热闹中享受着梦幻般的时光。在加帕里公园顺利开业之前，其实有一场巨大危机。这是讲述跨越危机的朋友们和「园长」的冒险故事。担任公园向导的未来小姐和曾经参与冒险的薮猫一行，将这个故事记录了下来。救公园于危机之中的众多朋友们和「园长」出镜的乱哄哄的视频记录，你也来看看吧？

　　The protagonist, Masaru, has just inherited a big fortune after the death of his father. However, people are trying to get their hands on it by any means necessary, even if it means killing him. Narumi helps Masaru from being kidnapped after fighting strange figures. He finds out that they're not humans, but wooden puppets with amazing strength. After a hard fight, Narumi is forced to admit that he's no opponent for them; and just when he starts to think that Masaru will be captured, Shirogane, Masaru's watcher arrives from France with a weapon, the puppet Arlequin. Here begins the story of Karakuri Circus.

　　永远的“6时59分”开始了——
　　在佑河家有着代代相传的止界术使用止界术，能够进入森罗万象尽数停止的“止界”。某天，主人公树里的外甥和哥哥，被诱拐犯绑架了。她为了救出他们而不得已使用了“止界术”，却遭到不应存在于那里的、除自己以外的“会动的”人类袭击。他们是尊崇止界术的“真纯实爱会”。围绕着使用止界术时所必需的“石头”，止界之谜、佑河家之谜逐渐浮出水面……

　　在人类将生活领域和自身欲望扩张到宇宙的时代，寻求自由的人们移民到宇宙中居住，他们的睿智孕育出发达的文明，不知不觉转变为对地球的一种威胁。
　　宇宙历0156年，地球联邦政府经历了与祖母星格兰地玛斯有史以来的第四次接触（4th note），也正是从这一年开始，联邦政府与【梅杜斯子民】之间的对抗正式拉开帷幕。
　　战争永无止境，牺牲不断增加……
　　为了打开战局，联邦政府派出一名英姿飒爽的青年加入战局。年轻人名叫斯巴鲁•一之濑，不仅长相帅气、成绩优异，而且是宇宙战舰【提拉米斯】的王牌驾驶员。
　　全人类的希望都寄托在他的身上。
　　——然而，他实际上是个难以融入提拉米斯舰内集体生活，整日将自己关在专用机“杜兰德尔”驾驶舱内的“窝里蹲”……