工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！

　　本作主人公冈部伦太郎（宫野真守 配音）是个患有严重中二病的大学生，自称为“凤凰院凶真”的他和伙伴们组成了“未来发明研究所”，在位于秋叶原的一个简陋实验室内进行各种古怪发明和调查。
　　2010年7月28日这天，冈部和青梅竹马真由理（花泽香菜 配音）一同去了科学讲义会场，在那里，他们遇见了天才少女牧濑红莉栖（今井麻美 配音）。让人意想不到的事情发生了，冈部在会馆楼道内听到一声惨叫，他闻声而至，发现了倒在血泊中的牧濑。冈部用手机短信将这件事告诉好友桥田至，这个举动，让世界都颠覆了。实验室里那个所谓的“未来道具”，竟然真的可以左右世界的进程，冈部自此成了孤独的观测者。
　　这一切都是命运石之门的选择。

　　“我想起来了……”沉睡的记忆与真相即将觉醒。
　　故事以长野县为舞台，高人气角色“长野三人组”大和敢助、诸伏高明、上原由衣将登场亮相。当毛利小五郎警视厅时期同事“鳄鱼”遭遇意外，与致使大和敢助“独眼”的神秘雪崩案交织，无法兑现的承诺和独眼中的残像就此重叠。雪花飞舞，真相与爱意终将明晰！这一次，毛利小五郎将不再沉睡，与柯南、大和敢助等人携手探案，亲手揭开掩埋于雪山之下的秘密与真相……

　　特种兵沈辣天生阴阳眼，在云南边境抓捕毒枭任务中，偶入古滇国山洞，遭遇远古祭祀干尸复活，沈辣小分队几乎全军覆没。在这危急时刻，神秘白发男子吴勉将沈辣和缉毒警察孙德胜一并救出。干尸事件后，二人机缘巧合进入“民俗事务调查研究局”，在一次次超自然事件中逐渐成长，揭开另一个世界的面纱。
　　这是一个无处不在却不为人知的世界
　　这个世界里，有一个神通广大隐匿在世人视野之外的神秘部门
　　有一群身怀秘术活得风生水起的凡人 还有那些超脱了轮回却依旧混迹凡尘的传奇
　　于芸芸众生而言，他们是看不见摸不着却又实实在在的坚强护盾
　　于邪魔外道而言，他们是令人欲除之而后快的眼中钉肉中刺
　　而对他们自己而言，他们只是有血有肉的人 有爱有恨，有喜有悲，身在大千世界，心怀大千世界
　　微不足道，却又重要无比。

　　名为数据界的多元宇宙中存储着对应真实世界的一切，其中承载着人类文明的文物数据们最终觉醒了自我意识，秘灵一族建立了一个守护同盟-秘宝之国。修复师们在调查自身本源的同时带领秘灵们对抗会吞噬一切的遗忘病毒。

　　当宁远发现自己被困死牢灯塔，钉墙不断逼近，而一墙之隔还关着女医学生苏瑾……奋力逃生并如约救出苏瑾后，坠海、失忆、面对敌人，一系列危险接踵而至，只有小学五年级记忆的宁远和善良胆小的苏瑾，在友情和义气、背叛与猜忌中如何自保？
　　魔术师、医学生、香港黑道、日本总裁……身份 各异素未谋面的人一梦惊醒，发现已经身陷荒岛，无法联系外界的他们面对种种危机，如何逃生？原始部落、神秘文明、变异病毒、诡异生物，在这座死亡之岛上无从梦中醒来的宁远，发现自己被关入死牢，除了不断靠近的钉板墙和同囚的女性，他一无所知。好不容易逃离死牢的他发现自己被送到了迷域之中的杀戮游戏中，要如何才能逃离迷域，逃离这个死亡游戏？

　　30名男女出于兴趣而参加了一个可疑的巴士旅游。旅游的目的地是名为纳鸣村的、无法确定其存在的奇幻村庄。根据都市传说，“纳鸣村”里面可以让人享受如同乌托邦一样的生活。
　　对于现实的世界绝望……想要从无聊的日常中脱身……想要人生重新来过……这30个人带着各自的思绪和心灵创伤，坐着巴士进入了深山之中……
　　而当他们来到目的地后，发现这儿是已经腐朽、稍微有一点点人气的无人部落。那么追逐着30人的、“纳鸣村”的真相是？不要错过任何一集！这种一个谜团接一个谜团的展开

　　平凡的中学生鹿目圆（悠木碧 配音）有一个美满的家庭，在生活中她是个性格温顺又有爱心的好孩子。转学生晓美焰（斋藤千和 配音）的出现打破了小圆平静的生活，这个性格酷酷又体弱多病的黑长直少女似乎对小圆有着什么难言之隐。命运中的相遇出现了，小圆在路边救下了一只浑身是伤的奇怪动物 ，没想到这只动物居然会说人类的语言。它告诉小圆它的名字叫丘比（加藤英美里 配音），并且提出了一个特殊的要求，它希望小圆能够和它签订契约成为魔法少女。
　　魔法少女是这个世界中一种特殊的存在，她们肩负着和魔女战斗的使命，作为报酬，丘比可以实现她们任意的一个愿望。在战斗的过程中，小圆发现魔法少女这个职业并非故事里所描绘的那么美好，随时有着牺牲的可能。并且，随着战斗的升级，一个关乎于她自己的残酷真相正在逐步的浮出水面。

　　漆黑的夜晚，一名间谍悄然潜入日本警方某机构，盗走了记载着各国谍报机构重要数据的绝密文件的绝密数据。日本警方和FBI探员赤井秀一（池田秀一 配音）旋即与间谍展开追逐。最后，逃亡者的车辆坠落悬崖。第二天，柯南（高山南 配音）和伙伴们来到东都水族馆观光，结果发现一名受伤的美丽女子（天海佑希 配音）。该女子处于失忆状态，身上的手机也破损无法使用。柯南等人答应要帮她恢复记忆，当他们七嘴八舌之际，藏在暗处的黑衣组织成员贝尔摩德（小山茉美 配音）冷冷地注视着这一切。在相处过程中，女子非凡的身手和奇怪的言行举止让灰原哀（林原惠美 配音）对其真实身份产生怀疑。
　　刚刚还一派祥和的水族馆，沉浸在快乐之中的人们，根本会想到随着那名神秘女子技艺的恢复，自己马上就要被卷入黑暗组织的杀戮和混乱之中……

　　东京峰会召开在即，为了确保会议顺利进行，日本警方出动约两万名警力对位于东京湾的超大设施“海洋边缘”进行安保工作。可就在严密的防控下，此地已然发生了爆炸案。令柯南（高山南 配音）等人始料未及的是，现场居然留下了对毛利小五郎（小山力也 配音）极其不利的证据。在此之后，小五郎 遭到逮捕。柯南则发现安室透曾出现在爆炸现场，并且负了伤。为了还毛利叔叔的清白，柯南和阿笠博士以及少年侦探团的小伙伴们联合起来勘察现场，搜集证据。随着调查的深入，柯南发现这起爆炸案隐藏着包括恐怖分子、公安在内多方的复杂关系，而真相更令所有人瞠目结舌……
　　本片是“名侦探柯南系列”第22部动画剧场版，票房总收入超过90亿日元。

　　每四年一届的体育界最大盛事——世界体育大会（世体会，WSG）即将在日本东京举行，届时时速达到惊人的1000公里的真空超导磁悬浮列车也将与世人见面。在世体会赞助商壮行会上，主办方宣布除了赞助方和嘉宾外，还将通过抽签的方式选出该列车首批荣幸之至的乘客。得到消息后，少年侦探团的各位跃跃欲试，殊不知意想不到的是突然发生。在壮行会上，许多高层领导接连遭到绑架。
　　危急关头，柯南与赤井秀一先后投入了与幕后真凶争分夺秒的抗争之中……

　　南洋富庶之国新加坡，著名的鱼尾狮突然喷涌鲜血，预示着新的阴谋和危机的到来。与此同时，京极真（桧山修之 配音）即将参加在新加坡举办的空手道锦标赛。为了给男友助威，土豪之女铃木园子（松井菜樱子 配音）邀请小兰（山崎和佳奈 配音）及其他的朋友们一同飞往新加坡。只不过由于新一正以小学生的身份存在，所以他没有护照。当一阵昏迷之后，柯南（高山南 配音）苏醒过来，惊讶地发现自己已经身处新加坡。而就在不远处，正在和小兰快乐交谈的居然是工藤新一。原来这一切都是怪盗基德（山口胜平 配音）搞的鬼，不久前鱼尾狮喷血事件，直接将罪名栽在基德身上。
　　而这一切凶险事件，都与空手道锦标赛的奖品——宝石“绀青之拳”息息相关……

　　正值万圣节之际，东京涉谷热闹非凡。涉谷HIKARIE大厦里正在举办一场婚礼，身着婚纱的便是——警视厅的佐藤警官。当柯南等宾客都在见证这场婚礼的时候，突如其来的暴徒向佐藤扑去！高木为了保护佐藤而受伤，好在性命无忧。可这时映入佐藤眼里的，是三年前爆炸事件松田阵平殉职时出现的死神的幻影，这一次出现在了高木的身上。
　　与此同时，那场连续爆炸事件的犯人越狱了！这是巧合吗？
　　这个犯人同时也是公安警察降谷零(安室透)宿命的敌人，因为他害死了自己的同学松田。在即将追到犯人之际，突然出现了一个神秘的变装人物，给安室装上了项圈炸弹。为了解除项圈炸弹，柯南赶到了安室潜伏的地下避难所。柯南从安室口中得知了另一桩事件——三年前，安室和警校同学(现已亡)在涉谷遇到了身份不明的变装炸弹犯「普拉米亚」。
　　然而这时，危险已经开始笼罩搜查中的柯南等人……

　　怪盗基德的预告信出现在了北海道函馆，斧江财阀的收藏库中。这次基德将要盗走的是，江戸幕府时期新选组副长土方岁三的日本刀。向来追逐奢华宝石的怪盗基德，居然会看上刀？
　　此时，被称作西部名侦探的服部平次和柯南一行人，也因为剑道大会来到了函馆，在基德执行预告的当日，平次看穿了基德的伪装并对其穷追不舍！
　　同一时间，一具尸体在函馆仓库街被发现，尸体的胸口有一个十字伤口。搜查中，出现了一位被叫做“死之商人”的活跃于亚洲一带的美籍日裔军火商。这个人一直在寻找斧江家初代家主藏在函馆的宝藏。斧江家江戸幕府战争时代深耕军需产业，传说那宝藏是能扭转幕末纷争的强力武器，而这宝藏似乎和基德追逐欲盗取的刀有着千丝万缕的联系。在基德瞄准刀的同时，有一位剑士也在向基德逼近……

　　2012年にテレビアニメ化が予定されている。テレビアニメに先駆け、2012年12月29日にTOHOシネマズ六本木ヒルズにて抽選で240名を招いてイベント上映される予定であり、放送は翌々日の大晦日、12月31日の22時から24時まで、TOKYO MX（東京地区、地上デジタル放送）、BS11（BSデジタル放送）、ニコニコ生放送（ネット配信）の3メディアで同時放送される。

　　物理学家海因茨·施奈德遇害事件的重大嫌疑犯爱丽丝被黑道悬赏了巨额赏金。
　　女性赏金猎人娜蒂在墨西哥遇到爱丽丝，但她不是来逮捕爱丽丝的，而是奉主雇的要求来保护爱丽丝的。
　　爱丽丝要去南方的故乡，娜蒂决定陪伴爱丽丝一同前进，但是大路前方，是赏金猎人里卡多、神秘少年L.A的埋伏，而娜蒂的主雇茱迪小姐，也似乎有所隐瞒。学者道格拉斯·罗森伯格则按兵不动，似乎一切都在他的计划之中。
　　魔女的传说，路途的危机四伏，娜蒂与爱丽丝能到达她们的目的地吗？