这是一个人人都可以成为魔法使的世界，只要办理了相关的手续，每个人都可以合法的使用魔法，让生活更加便捷。但是，魔法使分为见习和正式两类，见习魔法使唯有遵循魔法守则，好好修炼，多多利用魔法帮助他人，才有机会转正。我们的主角，天正可爱的少女菊池梦（宫崎葵 配音）就是这样一位善良的见习魔法使。
　　为了接受魔法使的训练，梦从家乡来到了东京。繁华的大城市让她眼花缭乱，幸亏路人的相助，梦才得以找到自己的导师小山田雅美（诹访部顺一 配音）。为什么要使用魔法？魔法究竟带来的是幸福还是灾难？带着这些疑问，梦开始了自己的魔法修行，在经历了世间种种的悲欢离合后，梦逐渐的明白了魔法存在的意义。

一名作家在作品未完成之时不幸撒手人寰，留下了作品中没有结局的王子（矢剃直树 配音）独自徘徊，王子和故事中的宿敌乌鸦来到了现实世界中，为了保护现实世界里的生灵，王子用自己的心封印了邪恶的乌鸦。                                                                      　　作家的鬼魂不甘心看到自己的故事就此停滞，他给了一只鸭子一条神奇的项链，鸭子因此而化身成为了雅喜儿（加藤奈奈绘 配音），她的使命就是找到王子因为封印乌鸦而四处散落的心之碎片。一次偶然中，法齐亚（樱井孝宏 配音）拾得了王子的心脏，将其取名为缪，害怕雅喜儿将缪诗夺走的法齐亚禁止两人见面，但缪诗反而因此而对雅喜儿充满了好奇。

　　在远古的时代，宇宙中存在着分别代表光明与黑暗的两个文明，正如光与影永远是相互矛盾的，两个文明也长年处于战争之中，代表黑暗的文明为了取得胜利，就制造了一种高科技的战舰，这种战舰拥有超强的作战能力及穿越时空的能力，而且，还拥有自己的思想。然而，这种战舰却会把驾驶者作为自己的食粮，以此来增强自己的力量。这种黑色的战舰就像魔鬼一样，会把敌人彻底毁灭，但同时也会吞噬驾驶员的生命。而在同一时间，为了对抗敌人的黑色战舰，代表光明的文明也创造了一艘白色战舰与黑色战舰抗衡。后来，两个文明都原因不明地消失了，而那些战舰却依然存在在宇宙的某个角落里，新时代的人为他们起了个名字——遗失之舰（LostShips）
　　故事发生的世界，是设定为Slayers中所称的“异世界”。故事重心围绕在“遗失之舰——飞天一号”上。而统治这个世界的魔王正是在中被消灭的异界魔王——黑暗之星。
　　由于将精神力变换为能量的“精神物理学”的发达，产生了超越光速技术的遥远未来。主人公凯恩在这个世界里解决着发生的各种各样的事故，这种工作称之为“TROUBLE CONTRACTOR”(麻烦终结者，简称T.C）。
　　凯恩（kane）的伙伴是加娜（Canal），表面上是人类，实际上是飞天一号的主电脑的立体投射映像。性格很可怕的，凯恩（kane）因为惹她生气而被扔出宇宙船（在宇宙中啊……生命啊）作为报复。
　　另一个伙伴是想成为“宇宙第一”的米丽（米Mill），原来米丽（mill）是个侦探，因为凯恩（kane）的关系被解雇，也成为了T.C。米丽（mill）的枪法和料理都非常好……就是料理的时候厨房会遭殃……

　　马德拉斯（小林沙苗 配音），一位行迹诡异的杀手，活跃在卡萨索尼卡王国内战的战场之上。玛格丽特（桑岛法子 配音），一笔价值不菲的遗产的唯一继承人，从小打到都是养尊处优的大小姐。这两个表面上看来毫无关联的女子，其唯一的共同点就是都失去了记忆。而玛格丽特唯一记得的，只有“马德拉斯”这一个名字。
　　一本神秘的绘本将玛格丽特带往了卡萨索尼卡，而国际犯罪组织安纺亦盯上了玛格丽特，他们派出了特务卡罗莎（森川智之 配音）潜伏在玛格丽特身边。在卡萨索尼卡，马德拉斯和玛格丽特终于相遇了，她们决定共同寻找绘本的起源和隐藏在其中的秘密，与此同时，马德拉斯和她的指导老师潘尼莎（雪野五月 配音）一起，揭露了安纺贩卖军火，并且想要掀起世界大战的巨大阴谋。

【故事简介】                                                                      　　能够管理世界的FRACTAL系统完成后，人类史上第一次走进入了不需要工作就能生活下去的乐园。                                                                      　　那之后过了千年——                                                                      　　系统虽然仍在运作，却已经没有人能够准确解析那个系统了。居住在世界上的大多数人类，都坚信只有维持该系统运作才是人类能够幸福的条件。                                                                      　　就在这个时候，位于大陆角落某个小岛FRACTAL系统开始了崩坏——于是，故事拉开了帷幕——                                                                      　　每天维持着淡泊生活的少年克雷恩，某一天救下了因被人追逐而倒在了悬崖下的少女芙琉。与少女的相遇让克雷恩的心也起了波动。可是，芙琉却消失了身影，只留下了一个胸针。在那枚胸针里，封印了一只跟芙琉长得一模一样的虚拟人物——奈莎。                                                                      　　与奈莎一同踏上了寻找芙琉的旅程的克雷恩。最终，他发现了“FRACTAL系统”的秘密——                                                                      　　【STAFF】                                                                      　　監督：山本寛                                                                      　　原作：マンデルプロ・エンジン                                                                      　　系列構成：岡田麿里                                                                      　　故事原案：東浩紀                                                                      　　角色原案：左                                                                      　　角色设计/总作画监督：田代雅子                                                                      　　布景设计：青木智由纪/井上雪江                                                                      　　道具设计：田中裕介                                                                      　　机械设计：林勇雄                                                                      　　美术监督/画像设计：袈裟丸绘美                                                                      　　色彩设计：中岛和子                                                                      　　摄影监督：石黑晴嗣                                                                      　　编集：坪根健太郎                                                                      　　音乐：鹿野草平                                                                      　　音响监督：鹤冈阳太                                                                      　　动画制作：A-1 Pictures                                                                      　　製作：FRACTALE製作委員会                                                                      　　【CAST】                                                                      　　库莱茵：小林优                                                                      　　芙琉妮：津田美波                                                                      　　妮莎：花泽香菜                                                                      　　恩利：井口裕香                                                                      　　桑达：浅沼晋太郎

故事发生在遥远的未来，金城拓人（保志总一朗 配音）本是一位平凡的大学生，某日，他和女友玛琪（桑岛法子 配音）参与了一场实验，然而，实验中发生了事故，导致邪恶的外星人弗兰克复活，试验所惨遭破坏，玛琪丧命，拓人亦因此而遭到了毁容。                                                                      　　在神秘人的帮助之下，拓人捡回了一条命，并且以龙·索玛的身份重新回到了大众的视线之中，此时的他内心里只有一个念头，那就是找到弗兰克，为女友报仇。从实验室逃脱之后，弗兰克意外邂逅了名为哈迪（桑岛法子 配音）的女子，并且成为了她的保护着，与此同时，哈蒂在机缘巧合之下成为了拓人的战友，命运让深陷情仇的三人再度相遇。