石桥茶子（铃木美咲 配音）是一个普通的中学生，和其他的同龄人一样，个性朴实的她过着每日两点一线的生活。学校的生活虽然一成不变，但有着好友们的陪伴，日子却并不难熬，但有一件事情令茶子十分的在意，那就是这个坐在自己身旁的同桌柴犬子（佐佐木未来 配音）。                                                                      　　虽然身着水手服，说着和自己一样的语言，但无论从外表还是行为上来看，柴犬子都是一只不折不扣的雌性柴犬。可是，除了自己，周围的同学们似乎都没有发现她的异常。如果就此提出疑问，或许会被当成怪人也说不成，更糟糕的是，自己的行为可能会伤害到积极融入班级中的柴犬子。说还是不说？茶子陷入了深深的矛盾之中。

　　由于父母双亡，年纪轻轻的古宫柚子（堀江由衣 配音）成为了古董店八百万堂的老板娘，虽然无依无靠，但有着茧（户松遥 配音）的陪伴，柚子并不觉得孤单。茧并不是人类，而是一只寄居在店里的猫神，专门守护被人们遗忘的记忆。
　　在茧的召唤下，各路神灵开始在八百万堂内聚集。个性单纯天真可爱的樱神芳乃（斋藤千和 配音），虽为女性但和茧有着结婚约定的正仓院笹鸣（茅野爱衣 配音）以及爱慕着柚子但有些害羞的狐神弓太（三瓶由布子 配音）。这些神仙虽然有着神奇的能力，但个性上却都有着天然呆的一面。在打打闹闹中，八百万堂新的一天又开始了。

　　故事发生在一个名为楢崎町的小镇上，这是一个拥有着神秘魔法力量的神奇小镇，在小镇的天空中，永远都挂着一道绚丽的彩虹，而在传说中，神明会实现居住在这个小镇里的人们每人一个愿望。
　　天海春彦（泰勇气 配音）是从小到大都生活自镇上的青年，一天，班上来了一个名为深峰莉子（清水爱 配音）的转校生，让春彦没有想到的是，这个女孩竟然是自己的义妹，他们在年龄很小的时候分开了，想不到命运的红线令两人于此时此刻重逢。莉子的出现让春彦的青梅竹马木之坂雾乃（宫崎羽衣 配音）感到了强烈的危机感，她一直默默的喜欢着春彦。

　　南春香（佐藤利奈 配音）是一个外表出色个性优秀的完美学生。在学校里，性格开朗温和的她是许多人爱慕的对象，饱坂（小野大辅 配音）就是其中的一员。学校里流传着许多和春香有关的传说，她更是以“第一代首领”的名号著称。在妹妹南夏奈（井上麻里奈 配音）和南千秋（茅原实里 配音）的眼中，春香是一个母亲般的存在。
　　夏奈是个四肢发达的运动型少女，个性活泼又有些迷糊的她是大家的开心果。可是在千秋眼中，夏奈是个十足的笨蛋，但这也恰恰是千秋表达爱意的特殊方式——毒舌。虽然外表冷漠行事老成，但千秋也有着意外细腻和幼稚的一面。南家的三个姐妹，各有各的特色，但三个人都是那么的善良和可爱，在小小的城市中，她们正展开着轻松又快乐的日常生活。

　　某日，野原新之助（矢岛晶子 配音）正在公园里和风间（真柴摩利 配音）、妮妮（林玉绪 配音）等朋友们玩耍，意外遇见了一位名为金有久美子（钉宫理惠 配音）的神秘女子，久美子告诉小新，自己来自于遥远的未来世界，而彼时已经长大成人的新之助，正是自己的未婚夫。
　　跟随着久美子，小新一行人来到了未来，在那里，金友电机的社长，亦是久美子的父亲金有增藏手握大权，并且绑架了一直和自己作对的新之助。得知小新的到来会阻碍自己的计划，增藏派出了刺客，在强大的敌人面前，小新能否顺利救出新之助，并且帮助面前这个陷入了黑暗之中的世界重新找回光明呢？